mybatis是半自动化的，sql写在xml里，便于管理， 解除sql与程序代码的耦合，同时可以防止SQL注入。hibernate是全自动的，sql很多都是自动生成的，无法直接维护sql,写sql的灵活度上hibernate不及mybatis。

========原文如下=====

Hibernate的优点：

1、hibernate是全自动，hibernate完全可以通过对象关系模型实现对数据库的操作，拥有完整的JavaBean对象与数据库的映射结构来自动生成sql。

2、功能强大，数据库无关性好，O/R映射能力强，需要写的代码很少，开发速度很快。

3、有更好的二级缓存机制，可以使用第三方缓存。

4、数据库移植性良好。

5、hibernate拥有完整的日志系统，hibernate日志系统非常健全，涉及广泛，包括sql记录、关系异常、优化警告、缓存提示、脏数据警告等

Hibernate的缺点：

1、学习门槛高，精通门槛更高，程序员如何设计O/R映射，在性能和对象模型之间如何取得平衡，以及怎样用好Hibernate方面需要的经验和能力都很强才行

2、hibernate的sql很多都是自动生成的，无法直接维护sql；虽然有hql查询，但功能还是不及sql强大，见到报表等变态需求时，hql查询要虚，也就是说hql查询是有局限的；hibernate虽然也支持原生sql查询，但开发模式上却与orm不同，需要转换思维，因此使用上有些不方便。总之写sql的灵活度上hibernate不及mybatis。

Mybatis的优点：

1、易于上手和掌握，提供了数据库查询的自动对象绑定功能，而且延续了很好的SQL使用经验，对于没有那么高的对象模型要求的项目来说，相当完美。

2、sql写在xml里，便于统一管理和优化， 解除sql与程序代码的耦合。

3、提供映射标签，支持对象与数据库的orm字段关系映射

4、 提供对象关系映射标签，支持对象关系组建维护

5、提供xml标签，支持编写动态sql。

6、速度相对于Hibernate的速度较快

Mybatis的缺点：

1、关联表多时，字段多的时候，sql工作量很大。

2、sql依赖于数据库，导致数据库移植性差。

3、由于xml里标签id必须唯一，导致DAO中方法不支持方法重载。

4、对象关系映射标签和字段映射标签仅仅是对映射关系的描述，具体实现仍然依赖于sql。

5、DAO层过于简单，对象组装的工作量较大。

6、不支持级联更新、级联删除。

7、Mybatis的日志除了基本记录功能外，其它功能薄弱很多。

8、编写动态sql时,不方便调试，尤其逻辑复杂时。

9、提供的写动态sql的xml标签功能简单，编写动态sql仍然受限，且可读性低。